不思議な異世界に迷い込んだマリオとルイージは、漂流している島々を訪れて大地をつなげていく冒険に出る。道中では個性豊かな人物たちとの出会いがあるほか、マリオたちの妨害をする暗躍集団やおなじみクッパ軍団の姿も。

トピックスページでは、冒険の拠点となる「船島」の新情報も公開。海を流れる「漂流島」への移動手段である「大砲」や、訪れた島へ移動できる「ワープ土管」、キノピオのショップにウワサ話好きのおばちゃんたちなど、賑やかな拠点になっていることがわかる。